由格鲁派祖师宗喀巴大士亲自创立于1409年。它是格鲁派中最早的一座寺院，所以是整个格鲁派传承的祖庭。是宗喀巴大师当年生活之地，也是他圆寂之处。藏族的孩子想进甘丹寺当僧人，就像我们考北大或清华一样困难。最有意思的是可以去僧人的课堂上旁听。

寺庙建筑有措庆大殿、夏孜扎仓、强孜扎仓，以及斯赤康、赤多康、斯东康等主殿。有灵塔96座，其中宗喀巴灵塔最为精湛，用厚金皮包裹，并镶嵌了大量珠宝和稀世珍品，更加金碧辉煌。